2004年、宇宙から飛来した、彗星のような球体がシアトル郊外の湖に急接近。その時、光の中かから、過去50年の間に行方不明になった4400人の人々が現れる。“生存者”は昔、失踪後の記憶がなく、不可解なことに歳をとっていなかった。 事件の真相究明に本葬する、国家安全保障局のトムとダイアナ。やがて“生存者”たちが、以前にはなかった不思議な能力を身につけていることが判明し・・・。